应用电子系主要承担电力电子与电力传动专业方向的教学任务，教学内容涉及基于电力电子技术进行电能变换，电能质量及电力传动控制，培养学生掌握电力电子与电力传动的理论和技术，具备电力电子功率变换器、新能源发电系统和电力系统电力电子设备等的设计、研发、调试和运行管理能力的应用型高级技术人才。
应用电子系是福建省电源学会的挂靠单位，编著出版了《AC-AC变换技术》、《DC-AC逆变技术及其应用》、《静止变流器》、《交流电动机直接转矩控制》等专著，在教学中多人获得校教学优秀奖，所授课程《电力电子技术》是校级精品课程。
